HĐXX thấy mức phạt tử hình VKS đề nghị với Phạm Trung Kiên là tương xứng với hành vi phạm tội nhận hối lộ nhưng bị cáo đã thành khẩn, ăn năn hối cải, đã nộp 42,2 tỷ đồng khắc phục hậu quả nên “không cần loại khỏi xã hội”. Việc này dựa trên cơ sở chính sách nhân đạo của pháp luật nhằm khuyến khích người tham nhũng nộp lại tiền. Phạm Trung Kiên vì thế được tuyên tù chung thân.
Ngược với bị cáo Kiên, tòa cho rằng cựu thứ trưởng Tô Anh Dũng, cựu cục trưởng Hương Lan đã nhận số tiền đặc biệt lớn, gây nhức nhối trong xã hội, mất niềm tin trong nhân dân nên cần áp dụng mức hình phạt cao hơn VKS đề nghị mới đủ sức răn đe.
Tòa tuyên Tô Anh Dũng 16 năm tù (VKS đề nghị 12-13 năm); Nguyễn Thị Hương Lan bị phạt tù chung thân (VKS đề nghị 18-19 năm) do nhận hối lộ.
Bị cáo Hoàng Văn Hưng (cựu Trưởng phòng Chính trị hậu cần, Cục An ninh điều tra, Bộ Công an) bị tuyên án chung thân về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”. Mức án này của Hoàng Văn Hưng cao hơn mức 19 – 20 năm tù Viện Kiểm sát đề nghị trước đó.